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MtbProt 结核分枝杆菌全蛋白质组芯片助力结核病感染机制研究
时间:2016-10-11 10:17:24

    巨噬细胞介导的先天免疫反应在宿主对抗病原体的防御中起到重要作用。近年来,已经看到大量的宿主蛋白可以作为限制因子抑制病毒在感染细胞中复制。然而,结核分枝杆菌(MTB)感染时抑制结核分枝杆菌的关键因子以及它们的作用机理尚未清楚。近期,来自中科院微生物所的刘翠华教授团队,对这方面的研究有了新的发现,研究结果于10月4日发表在《Scientific Reports》期刊上。

 

    酪氨酸磷酸酶PtpA是结核分枝杆菌在宿主细胞内生存所需的一个重要分泌效应蛋白,通过选择宿主泛素系统而抑制先天免疫。在这篇文章中,该研究团队发现了一个新的与PtpA互作的宿主蛋白TRIM27,并证明了TRIM27通过促进巨噬细胞的先天免疫反应和细胞凋亡抑制结核分枝杆菌的生存。而MTB 的PtpA蛋白可以通过竞争性结合TRIM27的Ring结构域,抑制TRIM27-promoted JNK/p38 MAPK信号通路的激活和细胞凋亡,从而说明TRIM27很可能是MTB在细胞内的抑制因子,其功能是拮抗MTB效应蛋白,例如PtpA。

 

 

    然而,作为重要的结核菌抑制蛋白,TRIM27的作用机制究竟如何?是否还有其它结核菌蛋白受到抑制作用?为了全局性地发现TRIM27相互作用的蛋白,该团队使用MtbProt结核分枝杆菌全蛋白质组芯片进行了筛选。该芯片包含了4262种MTB重组蛋白(覆盖~95%结核杆菌编码基因)。研究发现了321个候选TRIM27互作蛋白,其中29个是分泌蛋白,6个阳性分泌蛋白有很强的反应信号。所有候选TRIM27互作MTB蛋白和分泌蛋白分别用STRING分析 ,并进一步用GO分析和Pathway分析,发现TRIM27互作蛋白涉及新陈代谢、应激反应和细胞生存等众多重要的功能,说明TRM27具有广泛的细胞内抑菌作用。当然,PtpA也出现在分泌蛋白列表中,并呈现强结合信号,佐证了上述结论。

 

  

 

 

    研究团队使用的MTB结核分枝杆菌全蛋白质组芯片由我司开发并提供整体技术服务,可用于全局性的发现目标蛋白、小分子药物、核酸的相互作用蛋白,以为解析其作用机制提供线索。

 

    我司是国家高新技术企业,中国科学院生物物理研究所成果转化的标杆企业,专注于蛋白质芯片,是中国蛋白质芯片领域的领导企业,提供血清标志物筛选、药物作用靶标发现、疾病与宿主相互关系、信号通路蛋白质磷酸化、蛋白质表达、蛋白质相互作用、血清抗体谱筛选等多项蛋白水平组学技术服务项目。

 

Reference:
The ubiquitin ligase TRIM27 functions as a host restriction factor antagonized by Mycobacterium tuberculosis PtpA during mycobacterial infection.http://www.nature.com/articles/srep34827

 

 

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