血清标志物的发现对于早期、及时、准确的血清学诊断至关重要。利用蛋白质组芯片进行全局性、系统性地筛查对于特定疾病的生物标志物是一项有着巨大价值的研究工作。我们拥有一支专业的科研队伍,为血清标志物的发现研究提供整体方案设计、芯片筛选和数据分析,最终提供潜在标志物列表及详细的数据报告。
基于蛋白质芯片的血清标志物的筛选是获得生物标志物的第一步,后续仍需要严格的验证。就这一部分而言,分为三个部分:
1. 样品选择
样本的选择和质量极其重要。考虑到疾病的复杂性和个体差异性,需要准确记录每个样本的各个参数,以获得准确的和可靠的结论。
样本选择要求:
a. 有明确的临床诊断结论;
b. 血清收集时最好未进行治疗(除特别研究外)。
样本信息登记表(根据不同疾病额外需更多参数):
样本ID
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来源及编号
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年龄
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性别
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临床诊断结论
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其它特别备注
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备注:健康人随机选择但保证年龄分布和性别分布应与病人组一致。
取样步骤和要求:
a. 需用促凝采血管,采血量为6-10ml,收集血清3-5ml;
b. 血样需离心,离心转速为3000rpm,4℃,5分钟;
c. 所有血清标本用标准冻存管保存,1 ml/管,每例病人血清保存3-5管;所有标本于-20℃环境保存时间不大于7天, -86℃可长期保存。
2. 芯片筛选
按照本公司标准SOP执行,简述为:
a. 芯片封闭——使用BSA封闭芯片上为结合蛋白的位点。
b. 血清样品孵育——血清按照一定的比例稀释,在存在封闭剂的条件下加入到芯片表面,该步骤使得血清中存在的抗体同其特异性识别的抗原结合;
c. 清洗——去除未结合的蛋白和抗体;
d. 荧光检测——使用荧光标记的anti-Human-IgG或IgM或IgD的二抗针对性检测结合的抗体,清洗后置于荧光扫描仪下显示结果。
3. 数据分析
由本公司专业数据分析团队完成,具体方法简述为:
a. 依据芯片蛋白样品标记文件(Gel file)提取所有血清样本对应芯片上的所有蛋白点的荧光信号数据;
b. 使用基于背景的算法对芯片(样品)间的数据进行归一化处理;
c. 基于数学检验统计分析,找出在开放性肺结核、非开放性肺结核特异性蛋白,并计算其与健康人和其它对照组的P值。
d. 画出聚簇分析图和box-plot图,生成潜在血清标志物名单。
结核杆菌蛋白质组芯片及其分泌蛋白芯片,可用于发现结核病或结核感染相关的疾病标志物,如开放性肺结核、肺外结核、HIV共感染等。
人蛋白质组芯片,可用于发现肿瘤、自身免疫疾病等的疾病标志物。
以上获得的潜在标志物均需要更多样品和更严格的验证。